Medresetü’l-Mütehassısin’in Kelm ve Hikmet şubesini bitirdi. Çeşitli medrese ve okullarda öğretmenlik yaptı. 1924’rten 1933’teki Üniversite reformuna kadar Darülfünun’da hadis ve hadis tarihi dersleri verdi. 1939-1947 arasında diyanet işleri başkan vekilliği yaptı. 1947’de Şerefeddin Yaltkaya’nın ölümü üzerine atandığı diyanet işleri başkanlığını ölümüne kadar sürdürdü.
Diyanet işleri başkanı Ahmet Hamdi Akseki 9 Ocak 1951’de Ankara’da öldü.
Akseki halkın dini bilgi ihtiyacını karşılamak amacıyla Dini Dersler (1920, 3 cilt), İslam Dini Fıtridir (1925), İslam Dini (1933) gibi eserler yazdı.